2021年8月2日，JGG在线发表了中国中医科学院黄璐琦院士团队和中国科学院遗传与发育生物学研究所刘永鑫高级工程师合作题为“EVenn: Easy to create repeatable and editable Venn diagrams and Venn networks online”的研究论文。该论文介绍了一款用于数据交互性探索和可视化的一站式Venn图和Venn网络在线绘制平台。
https://doi.org/10.1016/j.jgg.2021.07.007自1880年首次提出以来，Venn图被广泛用于分析和展示多组数据集的交集、并集和差集的关系。当数据集小于5组时，经典的Venn图或Euler图呈现数据小巧美观，表意清晰 (图A, B, C)。当数据集增多时，UpSet图或Flower图则更适合数据展示 (图D, E)。除Venn图外，Venn网络可在呈现集合交并关系时清楚地展示每个特征，并且可以通过调整网络布局，更好地呈现数据集内部的复杂关系 (图F)。
该研究开发出的EVenn可以通过一次性输入数据，3分钟内完成上述5种Venn图和Venn网络的绘制，特别适合整合数据集的探索分析和比较可视化。同时EVenn还提供了3种统计分析方法 (Fisher’s exact test, random sample test, Jaccard similarity test) 用于评估2个集合的相似性，并可以计算任意组数据的交并关系，对于关键基因或菌群的筛选更加便捷有效。从2021年3月末有统计以来，Evenn共有1万多独立IP访问，日均使用百次。同时该网站配有详细的演示数据、图文操作教程和视频教程，为科研工作者提供了有力的数据统计支持。EVenn的访问网址：http://www.ehbio.com/test/venn/。
中国中医科学院中药资源中心陈同博士为论文第一作者，黄璐琦院士和刘永鑫高级工程师为该论文共同通讯作者。相关工作得到中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助。Tong Chen, Haiyan Zhang, Yu Liu, Yong-Xin Liu, Luqi Huang. (2021). EVenn: Easy to create repeatable and editable Venn diagrams and Venn networks online. Journal of Genetics and Genomics doi: https://doi.org/10.1016/j.jgg.2021.07.007猜你喜欢
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