今日Science：肠道免疫细胞如何控制营养吸收 | 热心肠日报
Science：免疫细胞怎样控制肠道的营养吸收？
Science[IF:41.845]
① 小鼠的小肠上皮能响应膳食碳水化合物，根据其可用度“按需”诱导消化吸收碳水化合物所需酶和转运蛋白的转录程序，伴随肠上皮的重塑（改变不同肠细胞亚群的比例）；② 这种“按需”的转录程序调控需要肠上皮与淋巴细胞间的互作回路，肠道γδ T细胞在其中起重要介导作用；③ 机制上，高碳水饮食可改变γδ T细胞的肠隐窝定位和转录组，γδ T细胞通过抑制3型天然淋巴细胞生成IL-22，调控肠上皮的碳水化合物相关转录程序。
γδ T cells regulate the intestinal response to nutrient sensing
03-19, doi: 10.1126/science.aba8310
【主编评语】肠道是一个多功能的器官，不仅要吸收营养，还要时刻抵御微生物的入侵，因而肠道必须能应对营养和微生物等环境信号的变化而发生适应性改变。Science最新发表的研究，揭示了肠道中的一种免疫细胞——γδ T细胞在调控肠道对高碳水饮食适应方面的关键作用，以及其中的肠上皮-免疫互作机制。该研究不仅鉴定出γδ T细胞在免疫防御以外的新功能，将肠道的营养吸收与免疫因素联系起来，也为饮食相关代谢疾病中的免疫改变提供了新视角。（@mildbreeze）
Cell：面向2030，精准医学的7大赛道
Cell[IF:38.637]
① 未来10年加速实现精准医学，有7大机遇；② 通过开放共享和合作的国际大型纵向队列，充分挖掘人群数据；③ 提高生物医学研究中人群和科研者的多样性和包容性；④ 用大数据和人工智能分析临床、分子和可穿戴设备等数据流；⑤ 用常规临床基因组学指导常见病和罕见病的预防、诊断和治疗；⑥ 电子健康档案将成为表型组和基因组研究的重要资源；⑦ 应用更加多样、更高分辨率的表型组学和环境暴露数据；⑧ 建立信任、隐私保护和价值回报，促进民众广泛参与。
Precision medicine in 2030—seven ways to transform healthcare
03-18, doi: 10.1016/j.cell.2021.01.015
【主编评语】精准医学通过纳入考虑个体在遗传、环境和生活方式方面的差异，为进一步改善人类健康带来希望。在Cell最新发表的评述文章中，作者提出了迈向精准医学的7条路径，值得研读。（@mildbreeze）
徐健+黄适：菌群和多组学分析揭示何为“牙龈亚健康”
mBio[IF:6.784]
① 纳入40名成人，测定牙菌斑菌群和代谢组及唾液细胞因子在从健康到牙龈炎期间的变化；② 这些测量指标在停止刷牙后1-3天就已迅速改变，标志着牙龈进入亚健康（SoH）阶段，其特征包括11种唾液细胞因子活化、牙菌斑中有潜在保护作用的甜菜碱和罗氏菌快速协同减少；③ 对不同队列的荟萃分析显示，在SoH阶段牙菌斑菌群的组成和功能特征已与牙周炎高度接近；④ 持续的SoH发展能加速牙菌斑菌群衰老，28天内的衰老程度相当于牙龈健康时1年的衰老。
Longitudinal Multi-omics and Microbiome Meta-analysis Identify an Asymptomatic Gingival State That Links Gingivitis, Periodontitis, and Aging
03-09, doi: 10.1128/mBio.03281-20
【主编评语】中科院青岛能源所徐健、黄适与研究团队，近期在mBio发表研究，通过对志愿者牙龈健康恶化过程中的牙菌斑菌群、牙菌斑代谢组和唾液细胞因子进行综合分析，首次提出“牙龈亚健康”这一概念，并揭示了牙菌斑菌群在其中的驱动作用和机制，强调了日常口腔清洁以及牙龈亚健康阶段干预的重要性。（@mildbreeze）
饮食质量如何影响牙周病风险
Journal of Clinical Periodontology[IF:5.241]
① 纳入923名健康年轻成年人，通过问卷评估饮食质量，并进行全口腔检查；② 调整混杂因素后，替代健康饮食指数（AHEI）及先验饮食质量评分（APDQS）与平均牙周探诊深度（MPD）、平均临床附着丧失（MAL）及牙周炎均无显著关联；③ AHEI与探诊时出血百分比（%BOP）无显著关联，而APDQS与%BOP相关；④ 高坚果摄入与较低的MPD及牙周炎风险相关，高红肉摄入与较高的MPD以及%BOP相关，高反式脂肪酸摄入与较高的%BOP相关。
Diet quality and periodontal disease: Results from the oral infections, glucose intolerance and insulin resistance study (ORIGINS)
03-12, doi: 10.1111/jcpe.13450
【主编评语】饮食模式和牙周病的关联的相关研究较少。近期发表于Journal of Clinical Periodontology的一项前瞻性队列研究发现，总体饮食质量评分与牙周病风险无显著关联，但摄入较多的坚果与牙周炎发病率较低有关，而摄入较多的红肉与较高的平均牙周探诊深度及探诊时出血百分比相关，摄入较多的反式脂肪酸与较高的探诊时出血百分比相关。（@szx）
上海新华医院：流产孕妇的肠道菌群及细胞因子网络失调
NPJ Biofilms and Microbiomes[IF:7.067]
① 纳入41名流产孕妇及19名正常分娩的对照；② 流产孕妇的血清IL-2、IL-17A、IL-17F、TNF-α及IFN-γ的水平显著升高；③ 流产孕妇的粪便菌群多样性显著低于对照，粪便菌群中的普雷沃氏菌属_1、普雷沃氏菌科_UCG_003及月形单胞菌属_1的丰度显著降低；④ 流产孕妇的部分菌群相关代谢产物与Th1/Th17细胞因子的水平呈正相关；⑤ 咪唑丙酸及1,4-二甲基咪唑乙酸与反复流产相关。
Interactions between gut microbiota and metabolites modulate cytokine network imbalances in women with unexplained miscarriage
03-17, doi: 10.1038/s41522-021-00199-3
【主编评语】上海交通大学医学院附属新华医院的Jun Zhang团队及Liping Feng团队在NPJ Biofilms and Microbiomes上发表的一项病例-对照研究，对比了流产孕妇与正常分娩孕妇的血清细胞因子、粪便菌群及菌群代谢产物，发现流产孕妇血清中的多种炎症因子水平显著上调，粪便菌群多样性降低，部分粪便细菌分类群的丰度降低。另外，鉴定出某些菌群代谢产物与Th1/Th17细胞因子的水平相关，而特定菌群代谢产物与反复流产相关。（@szx）
苏州大学：生物节律如何影响肠道疾病？
CMGH Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology[IF:7.076]
① 采用社交时差、Bmal1-/-及Per1-/-Per2-/-小鼠，结合实验性结肠炎及相关结直肠癌（CRC）小鼠模型，研究生物节律失调对肠道的影响；② 上皮间调节性B细胞（Breg） PDL-1高表达可减轻结肠炎症状；③ 由于PDL1+ Breg受到抑制，诱导CD4+ T 细胞死亡，Bmal1-/-小鼠更易患结肠炎及CRC；④ IL-33是Bmal1转录靶标，在Bmal1 调节PDL1+Breg 中至关重要；⑤ 临床CRC样本分析显示，Bmal1在癌旁组织、肿瘤中心低表达，与CRC预后不良相关。
Circadian Clock Disruption Suppresses PDL1+ Intraepithelial B-cells in Experimental Colitis and Colitis Associated Colorectal Cancer
02-27, doi: 10.1016/j.jcmgh.2021.02.008
【主编评语】苏州大学医学部Jian-Ming Li、Tong Shen等在Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology发表文章，阐述肠道上皮间PDL1+调节性B细胞在IBD、CRC及生物节律失调小鼠模型中的重要功能与相关调节通路，包括Bmal1-IL-33- PDL1+ Breg- CD4+T细胞间的互作。（@solo）
Lancet子刊：国内团队报道新冠患者的胃肠道后遗症
Lancet Gastroenterology & Hepatology[IF:14.789]
① 纳入2020年1月16日至3月7日中国湖北、广东12间医院收治的COVID-19患者117名；② 出院后90天随访发现44%患者出现食欲减退、恶心、胃酸反流、腹泻等胃肠道后遗症；③ 与无胃肠道后遗症患者相比，有后遗症患者入院时血白细胞、中性粒细胞计数、C反应蛋白浓度偏高，呼吸困难和使用质子泵抑制剂比例偏高，而重症比例偏低；④ 患病时血氧饱和度降低与胃肠道后遗症相关，可能低氧介导了多器官功能衰竭，而营养支持似乎可降低该后遗症发生率。
Gastrointestinal sequelae 90 days after discharge for COVID-19
03-09, doi: 10.1016/S2468-1253(21)00076-5
【主编评语】中山大学附属第六医院兰平与研究团队近期在Lancet Gastroenterology & Hepatology发表文章，报道了新冠患者出院后3个月的胃肠道后遗症及其相关临床因素。（@mildbreeze）
DASH饮食降低老年人内脏肥胖指数
Clinical Nutrition[IF:6.36]
① 研究基于2011年至2014年的国家卫生和营养调查（NHANES）研究中共508名居住在社区的老年人的数据；② 在控制人口统计学变量后，参与者的平均DASH饮食得分为2.41，平均内脏肥胖指数（VAI）为1.55，采用多元线性回归分析显示DASH饮食得分和VAI之间存在显著的负相关；③ DASH饮食模式的健康效益可能部分归因于它与内脏肥胖的负相关性；④ 本研究表明，除了提供DASH饮食的营养咨询外，还可以利用VAI指标以减少老年人的心脏代谢风险。
Visceral adiposity index and its association with Dietary Approaches to Stop Hypertension (DASH) diet scores among older adults: National Health and Nutrition Examination Surveys 2011–2014
02-12, doi: 10.1016/j.clnu.2021.02.008
【主编评语】文章基于2011-2014年间美国社区老年人群，探究DASH饮食与其内脏肥胖指数（VAI）之间的相关性。研究结果显示，DASH膳食与VAI呈显著负相关。因此，文章建议，除了给老年人群提供DASH饮食咨询外，还可以利用VAI辅助评估老年人群的心脏代谢风险。（@兵兵）
Nature 子刊：农业生态系统中精准管理菌群的策略（综述）
Nature Plants[IF:13.256]
① 本文介绍了农业菌群研究的历史发展，重点介绍了有意进行微生物组操纵以提高作物性能和可持续性的最新进展和新兴策略。② 综述了在管理土壤、植物和昆虫相关的菌群方面当前实践和局限性，以及在多种农业系统中推进菌群信息化管理的下一步措施；③ 整合用于菌群操纵的无意和有意策略，并将历史进展组织成反映知识、方法和技术里程碑的农业菌群研究；④ 对定制化，预测性和整合性的未来精准的菌群管理的基础知识缺口和新兴战略的讨论。
Emerging strategies for precision microbiome management in diverse agroecosystems
03-08, doi: 10.1038/s41477-020-00830-9
【主编评语】近年来的研究表明，微生物组在植物生长、发育、抗病和抗逆过程中发挥重要作用，是实现可持续农业最有前途的手段之一。本文作者综合了目前管理农业菌群的实践和局限性，提出了研究重点，其中包括对作物菌群的整体看法，以实现在各种农业系统中量身定制，预测和整合的精确菌群管理的思路。为文将将为本领域未来的发展方向，起到一定的引领和指导作用。（@刘永鑫-中科院-宏基因组）
感谢本期日报的创作者：mildbreeze，lzm，临床营养陈彬林，szx，solo，fang fang，刘永鑫-中科院-宏基因组
点击阅读过去10天的日报：
0318 | 今日Nature：黑色瘤里的41种细菌和283种免疫原多肽
0316 | 调菌群治类风湿？16.6分自然综述详解“肠-关节”轴