妙哉！文学名著的经典语言，启发菌群研究~ | 热心肠日报
今天是第499期日报。
Nature子刊：菌群变化的“安娜·卡列尼娜原则”
Nature Microbiology[IF:N/A]
① “安娜·卡列尼娜原则”源于文学名著，在医学和健康领域释义为：健康/平衡状态都很相似，而疾病/失衡各有各的不同；② 动物菌群的干扰因素众多，变化随机，相比于菌群较类似的健康个体，失调个体间菌群差异更大；③ 菌群对压力产生不同响应，满足安娜·卡列尼娜原则，普遍存在于暴露在高温之下的珊瑚礁、HIV感染者的肺部等许多系统中；④ 以往的研究流程可能忽略这个原则，而更完备的实验体系、数据库和计算方法验证了该原则在菌群中的体现。
Stress and stability: applying the Anna Karenina principle to animal microbiomes
2017-08-24 DOI: 10.1038/nmicrobiol.2017.121
CID：艰难梭菌感染越严重，越要及早进行粪菌移植！
Clinical Infectious Diseases[IF:8.216]
① 严重艰难梭菌感染（CDI）患者死亡率很高，粪菌移植（FMT）可预防其复发；② 但有研究表明，FMT仅可改善O27核糖型CDI患者的生存率；③ 选取法国某医院13-16年间的111例CDI患者，其中FMT组66例，非FMT组45例；④ 结果显示：FMT显著提高了严重CDI患者的生存率，而对非严重病例无影响，且与年龄、性别、并发症、核糖型等其它因素无关；⑤ 可见，早期FMT可用于严重CDI的治疗，并需要进一步研究并发症和禁忌症。
Early Faecal Microbiota Transplantation Improves Survival in Severe Clostridium difficile Infections
2017-08-24 DOI: 10.1093/cid/cix762
JAC：四联益生菌显著改善腹泻而无法预防CDI复发
JOURNAL OF ANTIMICROBIAL CHEMOTHERAPY[IF:5.071]
① 选取33名艰难梭菌感染（CDI）患者，研究益生菌对CDI的疗效；② 干预持续28天，CDI患者分为2组，益生菌组每日口服包含4种菌株的益生菌胶囊（嗜酸乳杆菌NCFM、副干酪乳杆菌Lpc-37、乳双歧杆菌Bi-07、乳双歧杆菌Bl-04），对照组口服外观和味道相同的安慰剂；③ 益生菌组的腹泻症状得到显著改善：腹泻持续时间显著缩短，腹泻频率显著降低；④ CDI复发在两组之间无显著差别，需要更大样本量的随机临床试验进行进一步研究。
A randomized controlled trial of probiotics for Clostridium difficile infection in adults (PICO)
2017-08-23 DOI: 10.1093/jac/dkx254
BBI：菌群深入调节脑、行为和免疫
Brain Behavior and Immunity[IF:5.964]
① Brain, Behavior, and Immunity期刊的2017系列重点关注菌群相关研究；② 共生菌群可影响免疫系统活动、整个生命周期中的脑和行为过程、以及对社会压力的行为和免疫应答；③ 影响脑、行为和免疫的饮食会使肠道菌群改变，因此饮食可用于相关疾病的治疗，如益生菌预防和益生菌治疗；④ 肠道菌群的改变与情绪障碍（如抑郁症、精神分裂症，创伤性脑损伤）有关；⑤ 还需进一步将研究结果转化为临床实践。
The Microbiome as a Key Regulator of Brain, Behaviour and Immunity: Commentary on the 2017 Named Series
2017-08-23 DOI: 10.1016/j.bbi.2017.08.017
JAMA：眼睛也拥有自己的菌群！
JAMA[IF:44.405]
① 美国国家眼科研究所（NEI）的一项研究发现，眼睛如同身体的许多其它部位，拥有菌群并可防止眼部感染；② 利用眼表疾病小鼠模型，Rachel Caspi等人发现，一种棒状杆菌属的细菌C. mastitidis可在眼部粘膜处诱导γδ T细胞产生IL-17，招募中性粒细胞并在眼泪中释放抗菌物质；③ C. mastitidis引起的免疫反应可在致病性白色念珠菌及绿脓杆菌感染中起到保护作用；④ C. mastitidis为何未被自身引起的免疫反应清除还有待研究。
Even the Eye Has a Microbiome
2017-08-22 DOI: 10.1001/jama.2017.10599
SR：结肠内容物塑造黏液组织
Scientific Reports[IF:4.259]
① 结肠黏液屏障为覆盖结肠上皮的连续双层，将微生物与肠组织分开，而结肠的内容物和位置存在一致性；② 通过组织学和FISH染色鉴定啮齿动物近端和远端结肠中结肠黏液屏障组织，将具有或不具有结肠内容物的组织纵向切片和成像；③ 研究发现，粪便黏液层将微生物群限制在粪便中，并防止其残留在空的远端结肠，而在近端结肠中，黏液不形成细菌和上皮之间的分离层；④ 结肠黏液的组织取决于结肠内容物及其在结肠内的位置。
Mucus organisation is shaped by colonic content; a new view
2017-08-17 DOI: 10.1038/s41598-017-08938-3
SR：山西陈醋发酵过程中，菌群怎么变？
Scientific Reports[IF:4.259]
① 山西陈醋（SAV）是历史悠久的传统固态发酵品，454高通量测序和变性梯度凝胶电泳法检测发现SAV不同发酵阶段菌群组成发生显著变化；② 大曲中17种细菌属在酒精发酵第12天降至2种；③ 醋酸发酵第一天细菌属15种，第七天降到4种，包括醋杆菌属（50.9%）、乳杆菌属（47.9%）、葡糖醋杆菌属（0.7%）和丙酸杆菌属（0.1%）；④ 两种发酵过程中的真菌均以酿酒酵母为主；⑤ 气-质谱联用和HPLC检测到SAV发酵中87种非挥发性代谢物，且与菌群演替显著相关。
Unraveling the correlation between microbiota succession and metabolite changes in traditional Shanxi aged vinegar
2017-08-23 DOI: 10.1038/s41598-017-09850-6
SBB：粪肥将耐药基因带给土壤
Soil Biology & Biochemistry[IF:4.857]
① 为研究抗生素抗性基因（ARG）在施肥土壤中的传播机制与粪肥/土壤菌群对其的影响，进行土壤、土壤与辐照猪粪、猪粪与辐照土壤、猪粪与土壤四组实验；② 粪肥应用显著增加了土壤中ARG的多样性及丰度，并显著改变了与ARG相关的细菌组成；③ 机制是抗生素耐药性细菌的增加，及通过可移动遗传元件的潜在水平基因转移；④ 相反，土壤微生物阻止了ARG从粪便向土壤的传播，施肥土壤中ARG的丰度随时间的推移而下降，但仍高于对照土壤。
Do manure-borne or indigenous soil microorganisms influence the spread of antibiotic resistance genes in manured soil?
2017-07-29 DOI: 10.1016/j.soilbio.2017.07.022
感谢本期日报的创作者：鑫鑫鑫女开～，小扣啊，沈志勋，桃李不言
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