粪菌移植又立功，尿道感染、腹部包块缓解甚至消失~ | 热心肠日报
今天是第458期日报。
CID：粪菌移植后，CDI治愈，尿道感染缓解甚至消失
Clinical Infectious Diseases[IF:8.216]
① 来自美国梅奥诊所（梅奥医疗中心）的团队，对之前进行的临床研究项目中的数据进行二次分析；② 在接受粪菌移植（FMT）治疗复发性艰难梭菌感染（CDI）的病人中，有8位（2男6女，25-86岁，平均78.5岁）在接受FMT前一年报有3次或以上尿道感染；③ 接受FMT前，CDI平均发作4次，甲硝唑、万古霉素平均疗程分别为1.5和3；④ 接受FMT后一年，所有病人CDI不再复发，尿道感染发作平均次数从4降为1，其中3人不再发作。
Fecal Microbiota Transplantation for Recurrent Clostridium difficile Infection Reduces Recurrent Urinary Tract Infection Frequency
2017-07-18 DOI: 10.1093/cid/cix618
张发明等：一小时制备出粪菌，治CD合并腹腔包块，有效！
Scientific Reports[IF:4.259]
① 25例确诊克罗恩病合并腹腔炎性包块的病人，接受首次粪菌移植（FMT）后，每3个月再接受一次，持续时间至少6月，最长18月；② 首次FMT的临床响应和缓解率分别为：68.0%和 52.0%，接受后续FMT的病人，在第6、12、18月的持续缓解率分别为：48.0%、32.0%和 22.7%；③ 21名病人在治疗前后通过放射检查确认包块大小：2人消失，15人减小，2人无变化，2人增大；④ 使用新鲜菌液及“一小时方案（从供体移植到受体≤1小时）”或是治疗有效的重要因素。
Multiple fresh fecal microbiota transplants induces and maintains clinical remission in Crohn’s disease complicated with inflammatory mass
2017-07-06 DOI: 10.1038/s41598-017-04984-z
Nature子刊：化疗后疼痛，肠道菌群或是“帮凶”
Nature Neuroscience[IF:17.839]
① 化疗引起的疼痛大约影响30%接受化疗的肿瘤病人，其与化疗剂量大小相关；② 来自哈佛大学医学院的毛建仁教授和合作者发现，肠道菌群促进化疗引起的机械性痛敏的发展；③ 在无菌小鼠和抗生素预处理小鼠中，奥沙利铂引起的机械性痛敏降低，而重建无菌小鼠的肠道菌群会让这种保护作用消失；④ 这些效应似乎部分由包括巨噬细胞在内的造血细胞中表达的TLR4介导。
Gut microbiota is critical for the induction of chemotherapy-induced pain
2017-07-17 DOI: 10.1038/nn.4606
AR：一文读懂“胆汁酸-肠道菌群-胆汁淤积”三角（综述）
Autoimmunity Reviews[IF:8.961]
① 胆汁淤积性肝病表现为正常胆汁流的受损及潜在的毒性胆汁酸过度聚集；② 胆汁酸诱导产生细胞毒性作用的机制包括：线粒体和内质网氧化应激、直接激活死亡受体Fas和TRAIL-R2、肝细胞膜溶解；③ 肠道内的致病原相关分子方式通过门脉血液转运至肝，引起肝脏免疫异常，肠道菌群失调导致肠道免疫失衡，导致肝脏进一步炎症反应；④ 提出存在“胆汁酸-肠道菌群-胆汁淤积”的三角，在胆汁淤积性肝病的病理发生中起作用，靶向该三角有望成为有效疗法。
Bile Acids and Intestinal Microbiota in Autoimmune Cholestatic Liver Diseases
2017-07-08 DOI: 10.1016/j.autrev.2017.07.002
CI：甲状腺自身免疫病，或也与肠道菌群有关！（综述）
Clinical Immunology[IF:3.990]
① 小肠结肠炎耶尔森氏菌、幽门螺旋杆菌及其它一些细菌可能在格雷夫斯病（GD，毒性弥漫性甲状腺肿）的发病中起重要作用；② 细菌感染是否触发了自身免疫性甲状腺疾病尚未明确；③ 通过对风险因子（性别、吸烟、压力、怀孕等）的分析，揭示了GD患者的肠道菌群失调，但两者之间的致病性联系尚未建立；④ 传统细菌培养、体外模型、下一代高通量测序可用于评估细菌在GD发病及发展中的影响。
The microbiota and autoimmunity: Their role in thyroid autoimmune diseases
2017-07-06 DOI: 10.1016/j.clim.2017.07.001
AJRCCM：Nanopore新技术，快速鉴定肺炎病原菌！
American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine[IF:13.204]
① 临床用于鉴定肺炎病原菌的方法，仍然主要依赖效率低下的培养法，不利于降低发病和死亡率及控制抗生素滥用；② 测序技术被寄予厚望，但耗时、昂贵、耗人工及复杂的生物信息学，限制了它在临床的使用；③ Nanopore公司开发的掌上测序仪MinION，在之前已被用于血液和尿液样本的病毒及细菌病原体鉴定，也成功快速鉴定肺结核样本中的病原体物种；④ 在新研究中，MinION在数小时内即准确鉴定了两个肺炎病人的病原菌，展示出了良好的临床应用前景。
Rapid Pathogen Identification in Bacterial Pneumonia Using Real-time Metagenomics
2017-05-05 DOI: 10.1164/rccm.201703-0537LE
AJRCCM：Nanopore新技术，有突破但也还需改善！
American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine[IF:13.204]
① Pendleton等采用MinION直接从小支气管肺泡灌洗样本中快速鉴定呼吸道致病细菌，时间短，结果回报迅速；② 但在将临床宏基因组学（CMg）作为常规应用前，要考虑现有技术仍有进一步改进空间；③ 样本（特别是细菌感染样本）中可能含有大量白细胞，干扰读取的序列；④ 需要区分读取的序列是真正来源于菌群还是来源于试剂污染；⑤ 需定量分析医院获得性肺炎病原体的定殖与感染，但CMg仅能相对定性分析微生物，需要将定性信息转换为定量信息。
Clinical Metagenomics for the Diagnostic of Hospital-acquired Infections: Promises and Hurdles
2017-07-05 DOI: 10.1164/rccm.201705-0983LE
Lancet子刊：孩子呕吐/腹泻？直肠拭子取样或避免贻误诊断时机！
The Lancet Gastroenterology & Hepatology[IF:N/A]
① 检测肠致病菌传统上依赖于腹泻粪便样本，但常因样本不能立即获得而延误或错过诊断时机；② 共1519名受试者，1147提供粪便样本，1514提供直肠拭子样本；③ 871份粪便样本和1024拭子样本在所有致病菌检测中呈阳性；④ 对于呕吐、腹泻或二者兼有的儿童，直肠拭子样本鉴定出致病菌的概率为67%，而粪便样本为57%；⑤ 在相同个体中，粪便样本相对于拭子样本的相对产量较高；⑥ 建议重新考虑使用直肠拭子样本为肠致病菌的诊断样本。
Enteropathogen detection in children with diarrhoea, or vomiting, or both, comparing rectal flocked swabs with stool specimens: an outpatient cohort study
2017-07-14 DOI: 10.1016/S2468-1253(17)30160-7
感谢本期日报的创作者：热心肠先生，花开，沈志勋，this little piggy
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